En Crash Bandicoot: Mind Over Mutant Nintendo DS Neo Cortex pretende robar todos los cerebros del mundo y ha creado una máquina con la que podrá controlar tanto a los mutantes como a los bandicoot.

Nuestro deber será pues el de detener los malvados planes de Cortex, con la particularidad de que ahora podremos hacerlo llevando a Crash, o a Coco, la hermana y ayudante de Crash, si jugamos en cooperativo.

Otra de las novedades en Crash Bandicoot: Mind Over Mutant Nintendo DS es que ahora, Crash no sólo tendrá la habilidad de controlar a sus enemigos, sino que también podrá metérselos literalmente en el bolsillo, mejorarlos como si fueran un arma y utilizarlos cuando crea necesario.

La acción se desarrollará en la isla de Wampa, un extenso escenario diseñado con bastante realismo y que contendrá zonas que podremos desbloquear a medida que avancemos. En nuestro paso por la isla de Wampa iremos enfrentándonos a todo tipo de enemigos a la vez que ejecutamos nuevos movimientos exclusivos de Crash Bandicoot: Mind Over Mutant Nintendo DS como escalar, excavar o provocar daño adicional gracias a un nuevo movimiento.