Code of Honor 2: Conspiracy Island, nos sitúa en una invasión ficticia en Isla Real, perteneciente a la Guayana Francesa, por parte de un grupo de mercenarios contratados por el General Mendoza. El objetivo del dictador es localizar y secuestrar a los científicos franceses que trabajan en una base secreta de investigación atómica con el objetivo de crear un reactor nuclear experimental. El gobierno francés nos encargará evitar que tanto el reactor experimental como la tecnología nuclear caigan en manos de Mendoza, aunque para ello debamos poner en peligro nuestra vida.